明朝之吴派，以松江派为代表，崇尚对音弹唱。而常熟之诸琴家，反对对音，以弹奏为根本，近于浙操。其代表者为太仓人陈爱桐（十六世纪）。陈爱桐传其子陈星源（十六、十七世纪）、太仓张渭川（十六、十七世纪）。
陈星源传严天池（1547-1625）、徐上瀛（1582-1662）。张渭川亦传徐上瀛。严天池复从学于北京浙操名家沈太韶。徐上瀛复从学于严天池。
后严天池建琴川社，创立虞山琴派（熟派、琴川派），著有《松弦馆琴谱》。其琴风以清微澹远为特点。徐上瀛则著有《青山琴谱》（后名为《大还阁琴谱》）。而徐上瀛之名作《溪山琴况》为古琴美学之经典。徐上瀛亦有“今世之伯牙”之称。
徐上瀛传扬州庄臻凤（1624-1667）。庄氏作曲多有歌词。自此虞山派琴歌亦兴。庄臻凤传浙江金华人东皋禅师（1639-1696）。后东皋禅师将虞山琴学传至日本，传人见竹洞（医生）、杉浦琴川（幕府）等。杉浦琴川传幸田友之助。
十八世纪时，南通人王坦为虞山琴家，著有《琴旨》，有一定影响。
而虞山派之兴起，使时之各家，皆学其宗风。清朝以后，从虞山派中，亦直接分支出其他琴派。扬州之虞山琴家徐常遇（十七世纪），于扬州创建广陵琴派。山东诸城之虞山琴家王溥长（1807-1886），于诸城创建诸城琴派。
而至现代，虞山琴家苏州吴兰荪（？--1961），传其子吴兆基（1908-2002）。后吴兆基创建苏州吴门。
而天津虞山琴家王瑞璞（二十世纪）传常熟吴景略（1907-1987）。后吴景略创建虞山吴门，传琴于北京。而其早期学生张骥一、翁瘦苍（1916-2002），复传虞山派于常熟。张骥一传苏州徐忠伟。后徐忠伟为苏州吴门元老。翁瘦苍传朱晞（1964）。朱晞今传琴于常熟虞山琴社。
